Profesor Stefan Jurga prowadził interdyscyplinarne badania naukowe w obszarze nauk fizycznych, chemicznych, biologicznych i medycznych w zakresie nanonauki i nanotechnologii. Jego badania dotyczyły nanomateriałów, nanostruktur i nanokompozytów do multimodalnych zastosowań w naukach materiałowych, w biomedycynie, w ochronie środowiska. Badania Stefana Jurgi koncentrowały się na wytwarzaniu oraz charakteryzacji struktury i dynamiki molekularnej za pomocą obrazowania NMR, metod dyfrakcyjnych (SAXS, WAXS), mikroskopii elektronowej (TEM, SEM), mikroskopii sił atomowych (AFM), mikroskopii optycznej, relaksacji oraz dyfuzji NMR, spektroskopii dielektrycznej, spektroskopii FTIR, reologii, technik modelowania komputerowego. Jego dorobek naukowy to ponad 270 publikacji znajdujących się w interdyscyplinarnej bazie danych Journal Citation Reports (JCR). Był redaktorem czasopisma The Journal of Analytical Science and Technology (JAST) oraz współredaktorem naukowym serii „RNA Technologies” wydawanej przez Springer Verlag. Od roku 2005 kierował międzynarodową Letnią Szkołą Magnetycznego Rezonansu Jądrowego w Zakopanem (AMPERE NMR School), w której corocznie udział biorą wykładowcy i uczestnicy z ponad 20 krajów Europy i świata. W roku 2011 zainicjował coroczne międzynarodowe konferencje poświęcone nanonauce i nanotechnologii w Poznaniu, znane pod aktualną nazwą NanoTech Poland.

Profesor Jurga wypromował ponad 60. magistrów fizyki, ponad 20. doktorów, patronował 10. przewodom habilitacyjnym swoich współpracowników, z których trzech otrzymało tytuły profesorskie. Zarządzał dziesiątkami projektów badawczych i prowadzi szeroką współpracę naukową z wieloma ośrodkami badawczymi w kraju i za granicą. Był m.in. profesorem wizytującym na Uniwersytecie Cornella (Ithaca), na Uniwersytecie Stanowym Północnej Karoliny, Raleigh (USA), a także w Uniwersytecie Południowej Afryki w Pretorii (RPA). Prof. Jurga był laureatem Fundacji Alexandra von Humboldta oraz Fundacji Maxa Placka jako stypendysta w Instytucie Maxa Plancka do Badań Polimerowych w Moguncji (Niemcy). Pracował na Uniwersytecie Illinois w Urbana Champaign (USA), w Instytucie Jozefa Stefana w Lublanie (Słowenia), także w innych międzynarodowych instytucjach naukowych.

Prof. Stefan Jurga w latach 1990 -2002 był między innymi prorektorem i rektorem Uniwersytetu im. A. Mickiewicza w Poznaniu, stworzył interdyscyplinarne Centrum NanoBioMedyczne UAM, którego był dyrektorem w latach 2010 - 2022. Znacząco przyczynił się do powstania kampusu uniwersyteckiego na Morasku, powstania Collegium Polonicum w Słubicach nad Odrą oraz Kolegium Europejskiego w Gnieźnie. W latach 2005-2007 był podsekretarzem i sekretarzem stanu w Ministerstwach Edukacji i Nauki oraz Nauki i Szkolnictwa Wyższego. W latach 1999 - 2002 był przewodniczącym Konferencji Rektorów Uniwersytetów Polskich oraz wiceprzewodniczącym Konferencji Rektorów Akademickich Szkół Polskich. Był członkiem zarządu Międzynarodowego Towarzystwa Naukowego Groupement AMPERE, a w latach 2002 – 2012 był jego wiceprezydentem. Był także prezydentem Towarzystwa Uniwersytetów Europejskich „Grupa Santander”. Był członkiem Saksońskiej Akademii Nauk, doktorem honoris causa Uniwersytetu Warmińsko-Mazurskiego, został wyróżniony Złotym Medalem Uniwersytetu Gdańskiego oraz wieloma medalami innych europejskich uniwersytetów. Był także laureatem Fundacji na rzecz Nauki Polskiej w programie Międzynarodowe Projekty Doktoranckie. Posiadał wysokie odznaczenia państwowe oraz liczne wyróżnienia regionalne, między innymi Krzyżem Komandorskim Orderu Odrodzenia Polski, Krzyżem Komandorskim Orderu Świętego Sylwestra, Medalem Komisji Edukacji Narodowej, oraz Medalem 100. lecia Odzyskania Niepodległości (2019).