Profesor Stefan Jurga prowadzi interdyscyplinarne badania naukowe w obszarze nauk fizycznych, chemicznych, biologicznych i medycznych w zakresie nanonauki i nanotechnologii. Jego badania dotyczą nanomateriałów, nanostruktur i nanokompozytów  do multimodalnych zastosowań  w naukach materiałowych, w biomedycynie, w ochronie środowiska. Badania Stefana Jurgi koncentrują się na wytwarzaniu oraz charakteryzacji struktury i dynamiki molekularnej za pomocą obrazowania NMR, metod dyfrakcyjnych (SAXS, WAXS), mikroskopii elektronowej (TEM, SEM), mikroskopii sił atomowych (AFM), mikroskopii  optycznej, relaksacji oraz dyfuzji NMR, spektroskopii dielektrycznej, spektroskopii FTIR,  reologii, technik modelowania komputerowego.  W swoim  dorobku naukowym posiada ponad 270 publikacji znajdujących się w interdyscyplinarnej bazie danych Journal Citation Reports (JCR). Jest redaktorem czasopisma The Journal of Analytical Science and Technology (JAST) oraz współredaktorem naukowym serii „RNA Technologies” wydawanej przez Springer Verlag. Od roku 2005 kieruje międzynarodową Letnią Szkołą Magnetycznego Rezonansu Jądrowego w Zakopanem, w której biorą udział  wykładowcy i uczestnicy z ponad 20 krajów Europy i świata, a od roku 2011 roku organizuje coroczne międzynarodowe konferencje poświęcone nanonauce i nanotechnologii w Poznaniu, znane pod aktualną nazwą  NanoTech Poland.  

Profesor Jurga wypromował ponad 60. magistrów fizyki, ponad 20. doktorów, patronował 10. przewodom habilitacyjnym swoich współpracowników, z których trzech  otrzymało tytuły profesorskie. Zarządzał dziesiątkami projektów badawczych i prowadzi szeroką współpracę naukową z wieloma ośrodkami badawczymi w kraju i za granicą. Był m.in. profesorem wizytującym na Uniwersytecie Cornella (Ithaca), na Uniwersytecie Stanowym Północnej Karoliny, Raleigh (USA), a także w  Uniwersytecie Południowej Afryki w Pretorii (RPA). Prof. Jurga był laureatem Fundacji Alexandra von Humboldta oraz Fundacji Maxa Placka jako stypendysta w Instytucie Maxa Plancka do Badań Polimerowych w Moguncji (Niemcy). Pracował na Uniwersytecie Illinois w Urbana Champaign (USA), w Instytucie Jozefa Stefana w Lublanie (Słowenia), także w innych międzynarodowych instytucjach naukowych.

Prof. Stefan Jurga w latach 1990 -2002 był między innymi prorektorem i rektorem Uniwersytetu im. A. Mickiewicza w Poznaniu, stworzył interdyscyplinarne Centrum NanoBioMedyczne UAM, którego jest dyrektorem od roku 2010. Znacząco przyczynił się do powstania kampusu uniwersyteckiego na Morasku, powstania Collegium Polonicum w Słubicach nad Odrą oraz Kolegium Europejskiego w Gnieźnie. W latach 2005-2007 był podsekretarzem i sekretarzem stanu w Ministerstwach Edukacji i Nauki oraz Nauki i Szkolnictwa Wyższego. W latach 1999 - 2002 był przewodniczącym Konferencji Rektorów Uniwersytetów Polskich oraz wiceprzewodniczącym Konferencji Rektorów Akademickich Szkół Polskich. Jest członkiem zarządu Międzynarodowego Towarzystwa Naukowego Groupement AMPERE, a w latach 2002 – 2012 był jego wiceprezydentem. Był także prezydentem Towarzystwa Uniwersytetów Europejskich „Grupa Santander”. Jest członkiem Saksońskiej Akademii Nauk, doktorem honoris causa Uniwersytetu Warmińsko-Mazurskiego, jest wyróżniony Złotym Medalem Uniwersytetu Gdańskiego oraz wieloma medalami innych europejskich uniwersytetów. Jest także laureatem Fundacji na rzecz Nauki Polskiej w programie Międzynarodowe Projekty Doktoranckie. Posiada wysokie odznaczenia państwowe oraz liczne wyróżnienia regionalne. Jest odznaczony między innymi Krzyżem Komandorskim Orderu Odrodzenia Polski, Krzyżem Komandorskim Orderu Świętego Sylwestra, Medalem Komisji Edukacji Narodowej, Medalem 100. lecia Odzyskania Niepodległości (2019).